嫪毐带人冲进宫门，秦王大声喝道：“生擒嫪毐赏金百万，杀死嫪毐赏金50万！”
队伍中有人听到有这样的重赏，立刻倒戈扑向嫪毐，与嫪毐的亲信展开恶战。这时秦兵已经接到秦王的命令赶来救驾。嫪毐率领的乌合之众哪抵挡得住训练有素的大军，一经交手纷纷败阵。嫪毐本人也被活捉，经审讯后被车裂于东门之外。嫪毐整个家族也全都被杀尽，与太后私生二子也扑杀了事。太后被驱往嫚阳宫，派吏管束不准自由。就连没有参予其事的嫪毐食客也被流放到巴蜀。
秦王平定嫪毐的叛乱之后，丞相吕不韦被免去相国，革除“仲父”称号，离开京都，回到封地洛阳养老。
秦大臣等互相议论，多怪秦王背母忘恩，未免过甚，就中有几个激烈官吏上疏直谏，请秦王迎还太后。秦王政本来是个刻薄少恩的人，一阅谏书怒上加怒，竟命处死谏官，并榜示朝堂，敢谏者死。还有好几个不怕死的再去絮聒，徒落得自讨苦吃，身首分离。总计直谏被杀者已有二十七人，这时茅焦对秦王说“欲取天下，必尊孝道”，秦王这才把母亲放了出来，让她充当了一个可以让秦王尽孝的人物。
吕不韦回到封地洛阳之后足不出户，想在此安度晚年。不料有一天秦王派人送来一封信，信上写道：“君与秦究有何功，得封国河南，食十万户？君与秦究属何亲，得号仲父？今可率领家属速徙蜀中，毋得逗留！”
吕不韦览毕来信不由泪下。心想我是你的父亲啊！你还问我究属何亲？没有天哪有地？没有我哪有你？意欲上书申辩，转思父子关系统皆暧昧，未便明言，倘若唐突出去，反致速毙。想了又想，他觉得就是说明自己是他的亲父，秦王也不会承认，更不会和他去做亲子鉴定！当晚吕不韦便喝了鸩酒，须臾毙命。正是：
任君用尽千般计，
到头仍是一场空。
吕不韦死后，秦王又下了一道圣旨：凡参加吕不韦葬礼的官员，一律免职，流放他乡。没有参加葬礼，但与吕不韦生前关系密切的官员，保留官职流放他乡。吕不韦的子孙后代，永远不得入朝做官。
秦王稳定了内部以后，即着手对关东六国用兵，实现他统一天下的宏图。
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