万历三十七年，四十四岁。辽东总兵李成梁弃宽甸六堡；荷兰占澎湖。
万历三十八年，四十五岁。黄河决口淹没泗州明祖陵；西洋传教士熊三拔入京。
万历三十九年，四十六岁。李三才遭弹劾去职（东林党争激化）；山东白莲教起义。
万历四十年，四十七岁。辽东旱灾人相食；努尔哈赤征蒙古科尔沁部。
万历四十一年，四十八岁。梃击案：男子持棍闯东宫谋害太子，党争白热化。
万历四十二年，四十九岁。福王朱常洵就藩洛阳；李之藻译《同文算指》。
万历四十三年，五十岁。努尔哈赤建八旗制度；山东白莲教首徐鸿儒起义。这一年，英国公上疏言蒙古边事，神宗回复交由部议即可，这也是他这一生唯一一次上疏言及边事。
万历四十四年，五十一岁。后金建国：努尔哈赤称汗（2月），年号天命，明朝承认其国书。
万历四十五年，五十二岁。山东大饥荒；后金征黑龙江萨哈连部。
万历四十六年，五十三岁。后金攻明：努尔哈赤以“七大恨“伐明，陷抚顺、清河。
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